RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460573.5

C9orf3-209, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-209ENST00000460573 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.71■■■■■ 6.19
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C9orf3-209ENST00000460573 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.22■■■■■ 4.83
C9orf3-209ENST00000460573 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45■■■■■ 4.79
C9orf3-209ENST00000460573 NACADO15069 1562 aa44.94■■■■■ 4.78
C9orf3-209ENST00000460573 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
C9orf3-209ENST00000460573 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.58■■■■■ 4.73
C9orf3-209ENST00000460573 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.52■■■■■ 4.72
C9orf3-209ENST00000460573 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.15■■■■■ 4.66
C9orf3-209ENST00000460573 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.09■■■■■ 4.65
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C9orf3-209ENST00000460573 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.71■■■■■ 4.59
C9orf3-209ENST00000460573 SCRIBQ14160 1630 aa43.5■■■■■ 4.55
C9orf3-209ENST00000460573 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.25■■■■■ 4.51
C9orf3-209ENST00000460573 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.73■■■■■ 4.43
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C9orf3-209ENST00000460573 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.57■■■■■ 4.41
C9orf3-209ENST00000460573 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
C9orf3-209ENST00000460573 SMARCA4P51532 1647 aa41.57■■■■■ 4.25
C9orf3-209ENST00000460573 NCAPD3P42695 1498 aa41.4■■■■■ 4.22
C9orf3-209ENST00000460573 SMARCA2P51531 1590 aa41.36■■■■■ 4.21
C9orf3-209ENST00000460573 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.35■■■■■ 4.21
C9orf3-209ENST00000460573 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.35■■■■■ 4.21
C9orf3-209ENST00000460573 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.2■■■■■ 4.19
C9orf3-209ENST00000460573 HMGXB3Q12766 1538 aa41.19■■■■■ 4.18
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C9orf3-209ENST00000460573 WIZO95785 1651 aa40.91■■■■■ 4.14
C9orf3-209ENST00000460573 NESP48681 1621 aa40.67■■■■■ 4.1
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C9orf3-209ENST00000460573 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.3■■■■■ 4.04
C9orf3-209ENST00000460573 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.25■■■■■ 4.03
C9orf3-209ENST00000460573 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.22■■■■■ 4.03
C9orf3-209ENST00000460573 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
C9orf3-209ENST00000460573 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.1■■■■■ 4.01
C9orf3-209ENST00000460573 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.07■■■■■ 4.01
C9orf3-209ENST00000460573 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.9■■■■□ 3.98
C9orf3-209ENST00000460573 CFTRP13569 1480 aa39.87■■■■□ 3.97
C9orf3-209ENST00000460573 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.86■■■■□ 3.97
C9orf3-209ENST00000460573 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.81■■■■□ 3.96
C9orf3-209ENST00000460573 WDR62O43379 1518 aa39.74■■■■□ 3.95
C9orf3-209ENST00000460573 PRDM2Q13029 1718 aa39.6■■■■□ 3.93
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C9orf3-209ENST00000460573 ABCC8Q09428 1581 aa39.07■■■■□ 3.84
C9orf3-209ENST00000460573 TOPBP1Q92547 1522 aa39.06■■■■□ 3.84
C9orf3-209ENST00000460573 IFT140Q96RY7 1462 aa39.02■■■■□ 3.84
C9orf3-209ENST00000460573 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.99■■■■□ 3.83
C9orf3-209ENST00000460573 OSCARQ8IYS5 282 aa38.86■■■■□ 3.81
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C9orf3-209ENST00000460573 TRIM41Q8WV44 630 aa38.7■■■■□ 3.79
C9orf3-209ENST00000460573 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
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C9orf3-209ENST00000460573 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.6■■■■□ 3.77
C9orf3-209ENST00000460573 TOP2BQ02880 1626 aa38.59■■■■□ 3.77
C9orf3-209ENST00000460573 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.58■■■■□ 3.776e-7■■■□□ 16.8
C9orf3-209ENST00000460573 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.57■■■■□ 3.77
C9orf3-209ENST00000460573 SOGA1O94964 1423 aa38.55■■■■□ 3.76
C9orf3-209ENST00000460573 SYNJ1O43426 1573 aa38.54■■■■□ 3.76
C9orf3-209ENST00000460573 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.54■■■■□ 3.76
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C9orf3-209ENST00000460573 CHD1O14646 1710 aa38.42■■■■□ 3.74
C9orf3-209ENST00000460573 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
C9orf3-209ENST00000460573 WDR97A6NE52 1622 aa38.36■■■■□ 3.73
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C9orf3-209ENST00000460573 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.29■■■■□ 3.72
C9orf3-209ENST00000460573 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.29■■■■□ 3.72
C9orf3-209ENST00000460573 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.28■■■■□ 3.72
C9orf3-209ENST00000460573 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.24■■■■□ 3.71
C9orf3-209ENST00000460573 GRIN2BQ13224 1484 aa38.19■■■■□ 3.7
C9orf3-209ENST00000460573 ARHGEF11O15085 1522 aa38.18■■■■□ 3.7
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C9orf3-209ENST00000460573 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
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C9orf3-209ENST00000460573 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.05■■■■□ 3.68
C9orf3-209ENST00000460573 SYNJ2O15056 1496 aa38■■■■□ 3.67
C9orf3-209ENST00000460573 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.95■■■■□ 3.67
C9orf3-209ENST00000460573 KIF27Q86VH2 1401 aa37.92■■■■□ 3.66
C9orf3-209ENST00000460573 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.9■■■■□ 3.66
C9orf3-209ENST00000460573 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.86■■■■□ 3.65
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C9orf3-209ENST00000460573 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.59■■■■□ 3.61
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C9orf3-209ENST00000460573 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
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C9orf3-209ENST00000460573 CEP170Q5SW79 1584 aa37.5■■■■□ 3.59
C9orf3-209ENST00000460573 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.49■■■■□ 3.59
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