RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592863.2

POLRMT-208, Transcript of RNA polymerase mitochondrial, humanhuman

TSL 5

Gene POLRMT, Length 966 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMT-208ENST00000592863 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.01■■■■■ 5.6
POLRMT-208ENST00000592863 ABCC9O60706 1549 aa45.04■■■■■ 4.8
POLRMT-208ENST00000592863 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.02■■■■■ 4.8
POLRMT-208ENST00000592863 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.86■■■■■ 4.45
POLRMT-208ENST00000592863 NACADO15069 1562 aa42.52■■■■■ 4.4
POLRMT-208ENST00000592863 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.22■■■■■ 4.35
POLRMT-208ENST00000592863 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.18■■■■■ 4.34
POLRMT-208ENST00000592863 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.95■■■■■ 4.31
POLRMT-208ENST00000592863 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.85■■■■■ 4.29
POLRMT-208ENST00000592863 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.85■■■■■ 4.29
POLRMT-208ENST00000592863 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.57■■■■■ 4.25
POLRMT-208ENST00000592863 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
POLRMT-208ENST00000592863 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.3■■■■■ 4.2
POLRMT-208ENST00000592863 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.03■■■■■ 4.16
POLRMT-208ENST00000592863 SCRIBQ14160 1630 aa41.03■■■■■ 4.16
POLRMT-208ENST00000592863 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.71■■■■■ 4.11
POLRMT-208ENST00000592863 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
POLRMT-208ENST00000592863 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.58■■■■■ 4.09
POLRMT-208ENST00000592863 NCAPD3P42695 1498 aa39.18■■■■□ 3.86
POLRMT-208ENST00000592863 SMARCA4P51532 1647 aa39.09■■■■□ 3.85
POLRMT-208ENST00000592863 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.08■■■■□ 3.85
POLRMT-208ENST00000592863 SMARCA2P51531 1590 aa39.03■■■■□ 3.84
POLRMT-208ENST00000592863 HMGXB3Q12766 1538 aa38.98■■■■□ 3.83
POLRMT-208ENST00000592863 ERCC6Q03468 1493 aa38.94■■■■□ 3.82
POLRMT-208ENST00000592863 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.87■■■■□ 3.81
POLRMT-208ENST00000592863 CUX2O14529 1486 aa38.86■■■■□ 3.81
POLRMT-208ENST00000592863 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.83■■■■□ 3.81
POLRMT-208ENST00000592863 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
POLRMT-208ENST00000592863 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.67■■■■□ 3.78
POLRMT-208ENST00000592863 NESP48681 1621 aa38.65■■■■□ 3.78
POLRMT-208ENST00000592863 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.53■■■■□ 3.76
POLRMT-208ENST00000592863 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.4■■■■□ 3.74
POLRMT-208ENST00000592863 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
POLRMT-208ENST00000592863 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.25■■■■□ 3.71
POLRMT-208ENST00000592863 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.14■■■■□ 3.7
POLRMT-208ENST00000592863 WIZO95785 1651 aa38.12■■■■□ 3.69
POLRMT-208ENST00000592863 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.99■■■■□ 3.67
POLRMT-208ENST00000592863 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.86■■■■□ 3.65
POLRMT-208ENST00000592863 WDR62O43379 1518 aa37.77■■■■□ 3.64
POLRMT-208ENST00000592863 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.71■■■■□ 3.63
POLRMT-208ENST00000592863 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
POLRMT-208ENST00000592863 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
POLRMT-208ENST00000592863 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.63■■■■□ 3.61
POLRMT-208ENST00000592863 CFTRP13569 1480 aa37.56■■■■□ 3.6
POLRMT-208ENST00000592863 PRDM2Q13029 1718 aa37.35■■■■□ 3.57
POLRMT-208ENST00000592863 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
POLRMT-208ENST00000592863 TRIM41Q8WV44 630 aa37.18■■■■□ 3.54
POLRMT-208ENST00000592863 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.14■■■■□ 3.54
POLRMT-208ENST00000592863 OSCARQ8IYS5 282 aa36.98■■■■□ 3.51
POLRMT-208ENST00000592863 IFT140Q96RY7 1462 aa36.92■■■■□ 3.5
POLRMT-208ENST00000592863 TOPBP1Q92547 1522 aa36.9■■■■□ 3.5
POLRMT-208ENST00000592863 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
POLRMT-208ENST00000592863 ABCC8Q09428 1581 aa36.79■■■■□ 3.48
POLRMT-208ENST00000592863 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.79■■■■□ 3.48
POLRMT-208ENST00000592863 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
POLRMT-208ENST00000592863 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.64■■■■□ 3.46
POLRMT-208ENST00000592863 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.64■■■■□ 3.46
POLRMT-208ENST00000592863 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.64■■■■□ 3.46
POLRMT-208ENST00000592863 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
POLRMT-208ENST00000592863 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
POLRMT-208ENST00000592863 CHD1O14646 1710 aa36.51■■■■□ 3.43
POLRMT-208ENST00000592863 ARHGEF11O15085 1522 aa36.49■■■■□ 3.43
POLRMT-208ENST00000592863 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.49■■■■□ 3.43
POLRMT-208ENST00000592863 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.37■■■■□ 3.41
POLRMT-208ENST00000592863 SOGA1O94964 1423 aa36.31■■■■□ 3.4
POLRMT-208ENST00000592863 FBLN2P98095 1184 aa36.29■■■■□ 3.4
POLRMT-208ENST00000592863 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.29■■■■□ 3.4
POLRMT-208ENST00000592863 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
POLRMT-208ENST00000592863 WDR97A6NE52 1622 aa36.24■■■■□ 3.39
POLRMT-208ENST00000592863 CUX1P39880 1505 aa36.24■■■■□ 3.39
POLRMT-208ENST00000592863 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.18■■■■□ 3.38
POLRMT-208ENST00000592863 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.14■■■■□ 3.38
POLRMT-208ENST00000592863 ARAP1Q96P48 1450 aa36.11■■■■□ 3.37
POLRMT-208ENST00000592863 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
POLRMT-208ENST00000592863 GRIN2BQ13224 1484 aa36.05■■■■□ 3.36
POLRMT-208ENST00000592863 SYNJ1O43426 1573 aa36.02■■■■□ 3.36
POLRMT-208ENST00000592863 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.01■■■■□ 3.36
POLRMT-208ENST00000592863 PBRM1Q86U86 1689 aa36■■■■□ 3.35
POLRMT-208ENST00000592863 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
POLRMT-208ENST00000592863 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
POLRMT-208ENST00000592863 SYNJ2O15056 1496 aa35.94■■■■□ 3.34
POLRMT-208ENST00000592863 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.9■■■■□ 3.34
POLRMT-208ENST00000592863 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.86■■■■□ 3.33
POLRMT-208ENST00000592863 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.85■■■■□ 3.33
POLRMT-208ENST00000592863 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
POLRMT-208ENST00000592863 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.68■■■■□ 3.3
POLRMT-208ENST00000592863 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.68■■■■□ 3.3
POLRMT-208ENST00000592863 TOP2BQ02880 1626 aa35.65■■■■□ 3.3
POLRMT-208ENST00000592863 ADAMTS12P58397 1594 aa35.62■■■■□ 3.29
POLRMT-208ENST00000592863 GRIN2AQ12879 1464 aa35.6■■■■□ 3.29
POLRMT-208ENST00000592863 CEP170Q5SW79 1584 aa35.49■■■■□ 3.27
POLRMT-208ENST00000592863 NUP160Q12769 1436 aa35.44■■■■□ 3.26
POLRMT-208ENST00000592863 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.43■■■■□ 3.26
POLRMT-208ENST00000592863 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.43■■■■□ 3.26
POLRMT-208ENST00000592863 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.42■■■■□ 3.26
POLRMT-208ENST00000592863 SHROOM2Q13796 1616 aa35.35■■■■□ 3.25
POLRMT-208ENST00000592863 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.12■■■■□ 3.21
POLRMT-208ENST00000592863 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
POLRMT-208ENST00000592863 JPH4Q96JJ6 628 aa35.01■■■■□ 3.2
POLRMT-208ENST00000592863 CUL7Q14999 1698 aa34.95■■■■□ 3.19
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