RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531290.5

TRAPPC4-210, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 1,135 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-210ENST00000531290 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.11■■■■■ 6.41
TRAPPC4-210ENST00000531290 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.16■■■■■ 5.46
TRAPPC4-210ENST00000531290 ABCC9O60706 1549 aa49.14■■■■■ 5.46
TRAPPC4-210ENST00000531290 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.82■■■■■ 5.09
TRAPPC4-210ENST00000531290 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.69■■■■■ 5.06
TRAPPC4-210ENST00000531290 NACADO15069 1562 aa46.57■■■■■ 5.05
TRAPPC4-210ENST00000531290 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.01■■■■■ 4.96
TRAPPC4-210ENST00000531290 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.93■■■■■ 4.94
TRAPPC4-210ENST00000531290 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.92■■■■■ 4.94
TRAPPC4-210ENST00000531290 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.69■■■■■ 4.91
TRAPPC4-210ENST00000531290 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.51■■■■■ 4.88
TRAPPC4-210ENST00000531290 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.47■■■■■ 4.87
TRAPPC4-210ENST00000531290 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.37■■■■■ 4.85
TRAPPC4-210ENST00000531290 SCRIBQ14160 1630 aa44.92■■■■■ 4.78
TRAPPC4-210ENST00000531290 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.86■■■■■ 4.77
TRAPPC4-210ENST00000531290 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.3■■■■■ 4.68
TRAPPC4-210ENST00000531290 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
TRAPPC4-210ENST00000531290 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.26■■■■■ 4.68
TRAPPC4-210ENST00000531290 NCAPD3P42695 1498 aa43.06■■■■■ 4.48
TRAPPC4-210ENST00000531290 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.94■■■■■ 4.47
TRAPPC4-210ENST00000531290 SMARCA4P51532 1647 aa42.85■■■■■ 4.45
TRAPPC4-210ENST00000531290 SMARCA2P51531 1590 aa42.81■■■■■ 4.44
TRAPPC4-210ENST00000531290 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
TRAPPC4-210ENST00000531290 HMGXB3Q12766 1538 aa42.66■■■■■ 4.42
TRAPPC4-210ENST00000531290 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
TRAPPC4-210ENST00000531290 ERCC6Q03468 1493 aa42.46■■■■■ 4.39
TRAPPC4-210ENST00000531290 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.45■■■■■ 4.39
TRAPPC4-210ENST00000531290 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.44■■■■■ 4.38
TRAPPC4-210ENST00000531290 NESP48681 1621 aa42.24■■■■■ 4.35
TRAPPC4-210ENST00000531290 CUX2O14529 1486 aa42.23■■■■■ 4.35
TRAPPC4-210ENST00000531290 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.05■■■■■ 4.32
TRAPPC4-210ENST00000531290 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.96■■■■■ 4.31
TRAPPC4-210ENST00000531290 WIZO95785 1651 aa41.87■■■■■ 4.29
TRAPPC4-210ENST00000531290 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.86■■■■■ 4.29
TRAPPC4-210ENST00000531290 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.82■■■■■ 4.29
TRAPPC4-210ENST00000531290 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
TRAPPC4-210ENST00000531290 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
TRAPPC4-210ENST00000531290 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.53■■■■■ 4.24
TRAPPC4-210ENST00000531290 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
TRAPPC4-210ENST00000531290 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.4■■■■■ 4.22
TRAPPC4-210ENST00000531290 CFTRP13569 1480 aa41.33■■■■■ 4.21
TRAPPC4-210ENST00000531290 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.29■■■■■ 4.2
TRAPPC4-210ENST00000531290 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.28■■■■■ 4.2
TRAPPC4-210ENST00000531290 WDR62O43379 1518 aa41.22■■■■■ 4.19
TRAPPC4-210ENST00000531290 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.03■■■■■ 4.16
TRAPPC4-210ENST00000531290 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
TRAPPC4-210ENST00000531290 PRDM2Q13029 1718 aa40.6■■■■■ 4.09
TRAPPC4-210ENST00000531290 OSCARQ8IYS5 282 aa40.52■■■■■ 4.08
TRAPPC4-210ENST00000531290 TOPBP1Q92547 1522 aa40.49■■■■■ 4.07
TRAPPC4-210ENST00000531290 ABCC8Q09428 1581 aa40.48■■■■■ 4.07
TRAPPC4-210ENST00000531290 IFT140Q96RY7 1462 aa40.48■■■■■ 4.07
TRAPPC4-210ENST00000531290 TRIM41Q8WV44 630 aa40.36■■■■■ 4.05
TRAPPC4-210ENST00000531290 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
TRAPPC4-210ENST00000531290 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.32■■■■■ 4.05
TRAPPC4-210ENST00000531290 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
TRAPPC4-210ENST00000531290 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
TRAPPC4-210ENST00000531290 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.08■■■■■ 4.011e-6■■■■□ 24.3
TRAPPC4-210ENST00000531290 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
TRAPPC4-210ENST00000531290 SOGA1O94964 1423 aa40.03■■■■■ 4
TRAPPC4-210ENST00000531290 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
TRAPPC4-210ENST00000531290 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.99■■■■□ 3.99
TRAPPC4-210ENST00000531290 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
TRAPPC4-210ENST00000531290 FBLN2P98095 1184 aa39.91■■■■□ 3.98
TRAPPC4-210ENST00000531290 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.89■■■■□ 3.98
TRAPPC4-210ENST00000531290 CUX1P39880 1505 aa39.86■■■■□ 3.97
TRAPPC4-210ENST00000531290 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.69■■■■□ 3.94
TRAPPC4-210ENST00000531290 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.69■■■■□ 3.94
TRAPPC4-210ENST00000531290 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.69■■■■□ 3.94
TRAPPC4-210ENST00000531290 ARHGEF11O15085 1522 aa39.67■■■■□ 3.94
TRAPPC4-210ENST00000531290 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
TRAPPC4-210ENST00000531290 WDR97A6NE52 1622 aa39.65■■■■□ 3.94
TRAPPC4-210ENST00000531290 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.63■■■■□ 3.94
TRAPPC4-210ENST00000531290 GRIN2BQ13224 1484 aa39.6■■■■□ 3.93
TRAPPC4-210ENST00000531290 CHD1O14646 1710 aa39.6■■■■□ 3.93
TRAPPC4-210ENST00000531290 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.57■■■■□ 3.93
TRAPPC4-210ENST00000531290 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
TRAPPC4-210ENST00000531290 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.49■■■■□ 3.91
TRAPPC4-210ENST00000531290 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.45■■■■□ 3.91
TRAPPC4-210ENST00000531290 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.44■■■■□ 3.9
TRAPPC4-210ENST00000531290 SYNJ2O15056 1496 aa39.42■■■■□ 3.9
TRAPPC4-210ENST00000531290 SYNJ1O43426 1573 aa39.33■■■■□ 3.89
TRAPPC4-210ENST00000531290 ARAP1Q96P48 1450 aa39.3■■■■□ 3.88
TRAPPC4-210ENST00000531290 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.27■■■■□ 3.88
TRAPPC4-210ENST00000531290 TOP2BQ02880 1626 aa39.25■■■■□ 3.87
TRAPPC4-210ENST00000531290 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.25■■■■□ 3.87
TRAPPC4-210ENST00000531290 PBRM1Q86U86 1689 aa39.22■■■■□ 3.87
TRAPPC4-210ENST00000531290 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.18■■■■□ 3.86
TRAPPC4-210ENST00000531290 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
TRAPPC4-210ENST00000531290 GRIN2AQ12879 1464 aa39.05■■■■□ 3.84
TRAPPC4-210ENST00000531290 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.03■■■■□ 3.84
TRAPPC4-210ENST00000531290 ADAMTS12P58397 1594 aa38.96■■■■□ 3.83
TRAPPC4-210ENST00000531290 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.94■■■■□ 3.82
TRAPPC4-210ENST00000531290 NUP160Q12769 1436 aa38.92■■■■□ 3.82
TRAPPC4-210ENST00000531290 CEP170Q5SW79 1584 aa38.82■■■■□ 3.81
TRAPPC4-210ENST00000531290 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.68■■■■□ 3.78
TRAPPC4-210ENST00000531290 KIF27Q86VH2 1401 aa38.67■■■■□ 3.78
TRAPPC4-210ENST00000531290 JPH4Q96JJ6 628 aa38.67■■■■□ 3.78
TRAPPC4-210ENST00000531290 IGF1RP08069 1367 aa38.63■■■■□ 3.77
TRAPPC4-210ENST00000531290 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
TRAPPC4-210ENST00000531290 SHROOM2Q13796 1616 aa38.58■■■■□ 3.77
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