RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445181.5

C9orf3-207, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 873 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-207ENST00000445181 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.05■■■■■ 6.88
C9orf3-207ENST00000445181 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.81■■■■■ 5.88
C9orf3-207ENST00000445181 ABCC9O60706 1549 aa51.4■■■■■ 5.82
C9orf3-207ENST00000445181 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.11■■■■■ 5.45
C9orf3-207ENST00000445181 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.91■■■■■ 5.42
C9orf3-207ENST00000445181 NACADO15069 1562 aa48.9■■■■■ 5.42
C9orf3-207ENST00000445181 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.38■■■■■ 5.34
C9orf3-207ENST00000445181 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.2■■■■■ 5.31
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C9orf3-207ENST00000445181 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.96■■■■■ 5.27
C9orf3-207ENST00000445181 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.94■■■■■ 5.26
C9orf3-207ENST00000445181 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.8■■■■■ 5.24
C9orf3-207ENST00000445181 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.65■■■■■ 5.22
C9orf3-207ENST00000445181 SCRIBQ14160 1630 aa47.29■■■■■ 5.16
C9orf3-207ENST00000445181 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.04■■■■■ 5.12
C9orf3-207ENST00000445181 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.03
C9orf3-207ENST00000445181 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.42■■■■■ 5.02
C9orf3-207ENST00000445181 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.24■■■■■ 4.99
C9orf3-207ENST00000445181 NCAPD3P42695 1498 aa45.17■■■■■ 4.82
C9orf3-207ENST00000445181 SMARCA4P51532 1647 aa45.15■■■■■ 4.82
C9orf3-207ENST00000445181 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.1■■■■■ 4.81
C9orf3-207ENST00000445181 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.02■■■■■ 4.8
C9orf3-207ENST00000445181 SMARCA2P51531 1590 aa44.99■■■■■ 4.79
C9orf3-207ENST00000445181 HMGXB3Q12766 1538 aa44.83■■■■■ 4.77
C9orf3-207ENST00000445181 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.74■■■■■ 4.75
C9orf3-207ENST00000445181 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.74
C9orf3-207ENST00000445181 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.69■■■■■ 4.74
C9orf3-207ENST00000445181 ERCC6Q03468 1493 aa44.34■■■■■ 4.69
C9orf3-207ENST00000445181 NESP48681 1621 aa44.29■■■■■ 4.68
C9orf3-207ENST00000445181 WIZO95785 1651 aa44.21■■■■■ 4.67
C9orf3-207ENST00000445181 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.65
C9orf3-207ENST00000445181 CUX2O14529 1486 aa44.05■■■■■ 4.64
C9orf3-207ENST00000445181 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.04■■■■■ 4.64
C9orf3-207ENST00000445181 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.84■■■■■ 4.61
C9orf3-207ENST00000445181 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.81■■■■■ 4.6
C9orf3-207ENST00000445181 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.68■■■■■ 4.58
C9orf3-207ENST00000445181 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
C9orf3-207ENST00000445181 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
C9orf3-207ENST00000445181 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.52■■■■■ 4.56
C9orf3-207ENST00000445181 CFTRP13569 1480 aa43.42■■■■■ 4.54
C9orf3-207ENST00000445181 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.38■■■■■ 4.53
C9orf3-207ENST00000445181 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.32■■■■■ 4.53
C9orf3-207ENST00000445181 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.32■■■■■ 4.52
C9orf3-207ENST00000445181 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.23■■■■■ 4.51
C9orf3-207ENST00000445181 WDR62O43379 1518 aa43.22■■■■■ 4.51
C9orf3-207ENST00000445181 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
C9orf3-207ENST00000445181 PRDM2Q13029 1718 aa42.94■■■■■ 4.46
C9orf3-207ENST00000445181 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
C9orf3-207ENST00000445181 TOPBP1Q92547 1522 aa42.55■■■■■ 4.4
C9orf3-207ENST00000445181 ABCC8Q09428 1581 aa42.51■■■■■ 4.4
C9orf3-207ENST00000445181 IFT140Q96RY7 1462 aa42.43■■■■■ 4.38
C9orf3-207ENST00000445181 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.42■■■■■ 4.38
C9orf3-207ENST00000445181 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
C9orf3-207ENST00000445181 OSCARQ8IYS5 282 aa42.22■■■■■ 4.35
C9orf3-207ENST00000445181 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
C9orf3-207ENST00000445181 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
C9orf3-207ENST00000445181 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
C9orf3-207ENST00000445181 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.03■■■■■ 4.326e-7■■■□□ 16.6
C9orf3-207ENST00000445181 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.01■■■■■ 4.32
C9orf3-207ENST00000445181 SOGA1O94964 1423 aa42.01■■■■■ 4.32
C9orf3-207ENST00000445181 CUX1P39880 1505 aa42■■■■■ 4.31
C9orf3-207ENST00000445181 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.97■■■■■ 4.31
C9orf3-207ENST00000445181 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
C9orf3-207ENST00000445181 TRIM41Q8WV44 630 aa41.85■■■■■ 4.29
C9orf3-207ENST00000445181 FBLN2P98095 1184 aa41.7■■■■■ 4.27
C9orf3-207ENST00000445181 WDR97A6NE52 1622 aa41.69■■■■■ 4.26
C9orf3-207ENST00000445181 CHD1O14646 1710 aa41.65■■■■■ 4.26
C9orf3-207ENST00000445181 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.59■■■■■ 4.25
C9orf3-207ENST00000445181 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.59■■■■■ 4.25
C9orf3-207ENST00000445181 GRIN2BQ13224 1484 aa41.56■■■■■ 4.24
C9orf3-207ENST00000445181 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.51■■■■■ 4.24
C9orf3-207ENST00000445181 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.51■■■■■ 4.24
C9orf3-207ENST00000445181 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.51■■■■■ 4.24
C9orf3-207ENST00000445181 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.51■■■■■ 4.24
C9orf3-207ENST00000445181 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.49■■■■■ 4.23
C9orf3-207ENST00000445181 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
C9orf3-207ENST00000445181 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
C9orf3-207ENST00000445181 TOP2BQ02880 1626 aa41.46■■■■■ 4.23
C9orf3-207ENST00000445181 SYNJ1O43426 1573 aa41.46■■■■■ 4.23
C9orf3-207ENST00000445181 ARHGEF11O15085 1522 aa41.45■■■■■ 4.23
C9orf3-207ENST00000445181 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.44■■■■■ 4.22
C9orf3-207ENST00000445181 PBRM1Q86U86 1689 aa41.36■■■■■ 4.21
C9orf3-207ENST00000445181 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.36■■■■■ 4.21
C9orf3-207ENST00000445181 SYNJ2O15056 1496 aa41.35■■■■■ 4.21
C9orf3-207ENST00000445181 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.21■■■■■ 4.19
C9orf3-207ENST00000445181 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.2■■■■■ 4.19
C9orf3-207ENST00000445181 ARAP1Q96P48 1450 aa41.09■■■■■ 4.17
C9orf3-207ENST00000445181 ADAMTS12P58397 1594 aa41.02■■■■■ 4.16
C9orf3-207ENST00000445181 GRIN2AQ12879 1464 aa41.02■■■■■ 4.16
C9orf3-207ENST00000445181 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.99■■■■■ 4.15
C9orf3-207ENST00000445181 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.99■■■■■ 4.15
C9orf3-207ENST00000445181 NUP160Q12769 1436 aa40.85■■■■■ 4.13
C9orf3-207ENST00000445181 CEP170Q5SW79 1584 aa40.82■■■■■ 4.13
C9orf3-207ENST00000445181 KIF27Q86VH2 1401 aa40.73■■■■■ 4.11
C9orf3-207ENST00000445181 IGF1RP08069 1367 aa40.64■■■■■ 4.1
C9orf3-207ENST00000445181 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.62■■■■■ 4.09
C9orf3-207ENST00000445181 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
C9orf3-207ENST00000445181 SHROOM2Q13796 1616 aa40.57■■■■■ 4.09
C9orf3-207ENST00000445181 JPH4Q96JJ6 628 aa40.51■■■■■ 4.08
C9orf3-207ENST00000445181 CUL7Q14999 1698 aa40.47■■■■■ 4.07
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