Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FSCN3Q9NQT6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FSCN3Q9NQT6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FSCN3Q9NQT6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms