Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RSG1Q9BU20 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RSG1Q9BU20 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RSG1Q9BU20 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms