Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG68

TTL, Tubulin--tyrosine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLQ8NG68 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTLQ8NG68 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TTLQ8NG68 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTLQ8NG68 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms