Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNLDC1Q8NA58 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PNLDC1Q8NA58 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNLDC1Q8NA58 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms