Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC93Q567U6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC93Q567U6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC93Q567U6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC93Q567U6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164 ms