Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNEQ04844 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms