Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AIF1P55008 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AIF1P55008 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AIF1P55008 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AIF1P55008 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AIF1P55008 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AIF1P55008 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AIF1P55008 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AIF1P55008 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AIF1P55008 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AIF1P55008 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
AIF1P55008 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AIF1P55008 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AIF1P55008 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AIF1P55008 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AIF1P55008 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AIF1P55008 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AIF1P55008 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AIF1P55008 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AIF1P55008 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AIF1P55008 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AIF1P55008 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AIF1P55008 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AIF1P55008 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AIF1P55008 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AIF1P55008 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AIF1P55008 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AIF1P55008 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AIF1P55008 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AIF1P55008 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AIF1P55008 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AIF1P55008 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AIF1P55008 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AIF1P55008 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AIF1P55008 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AIF1P55008 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AIF1P55008 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AIF1P55008 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AIF1P55008 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AIF1P55008 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AIF1P55008 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AIF1P55008 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AIF1P55008 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AIF1P55008 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AIF1P55008 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AIF1P55008 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AIF1P55008 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AIF1P55008 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AIF1P55008 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AIF1P55008 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AIF1P55008 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AIF1P55008 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AIF1P55008 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AIF1P55008 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AIF1P55008 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AIF1P55008 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AIF1P55008 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AIF1P55008 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AIF1P55008 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AIF1P55008 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AIF1P55008 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AIF1P55008 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AIF1P55008 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AIF1P55008 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AIF1P55008 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AIF1P55008 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AIF1P55008 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AIF1P55008 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AIF1P55008 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AIF1P55008 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AIF1P55008 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AIF1P55008 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AIF1P55008 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AIF1P55008 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AIF1P55008 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AIF1P55008 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AIF1P55008 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AIF1P55008 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AIF1P55008 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AIF1P55008 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AIF1P55008 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AIF1P55008 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
AIF1P55008 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AIF1P55008 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AIF1P55008 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AIF1P55008 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AIF1P55008 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AIF1P55008 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AIF1P55008 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AIF1P55008 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AIF1P55008 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AIF1P55008 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AIF1P55008 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AIF1P55008 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AIF1P55008 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AIF1P55008 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AIF1P55008 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AIF1P55008 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AIF1P55008 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AIF1P55008 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms