Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2A2P52657 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GTF2A2P52657 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2A2P52657 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms