Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRIM27P14373 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRIM27P14373 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms