Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP4P12644 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BMP4P12644 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP4P12644 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP4P12644 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP4P12644 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP4P12644 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP4P12644 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BMP4P12644 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP4P12644 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP4P12644 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP4P12644 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP4P12644 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP4P12644 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP4P12644 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BMP4P12644 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP4P12644 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP4P12644 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP4P12644 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP4P12644 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP4P12644 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP4P12644 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP4P12644 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP4P12644 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP4P12644 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP4P12644 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BMP4P12644 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP4P12644 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP4P12644 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP4P12644 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP4P12644 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP4P12644 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP4P12644 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP4P12644 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP4P12644 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP4P12644 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP4P12644 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP4P12644 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP4P12644 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP4P12644 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP4P12644 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP4P12644 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP4P12644 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP4P12644 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP4P12644 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP4P12644 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP4P12644 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BMP4P12644 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BMP4P12644 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BMP4P12644 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BMP4P12644 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BMP4P12644 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP4P12644 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP4P12644 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP4P12644 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP4P12644 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP4P12644 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP4P12644 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP4P12644 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP4P12644 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP4P12644 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP4P12644 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP4P12644 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP4P12644 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP4P12644 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP4P12644 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP4P12644 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP4P12644 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP4P12644 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP4P12644 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP4P12644 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP4P12644 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP4P12644 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP4P12644 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP4P12644 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP4P12644 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP4P12644 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP4P12644 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP4P12644 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP4P12644 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP4P12644 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP4P12644 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP4P12644 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP4P12644 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP4P12644 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP4P12644 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP4P12644 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP4P12644 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP4P12644 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP4P12644 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP4P12644 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP4P12644 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP4P12644 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP4P12644 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP4P12644 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP4P12644 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP4P12644 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP4P12644 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP4P12644 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP4P12644 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms