Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PMF1-BGLAPU3KQ54 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PMF1-BGLAPU3KQ54 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PMF1-BGLAPU3KQ54 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms