Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF20Q9UGU0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms