Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS29Q9UBQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS29Q9UBQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS29Q9UBQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms