Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ4

TRIM34, Tripartite motif-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM34Q9BYJ4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM34Q9BYJ4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM34Q9BYJ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM34Q9BYJ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM34Q9BYJ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM34Q9BYJ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM34Q9BYJ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM34Q9BYJ4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM34Q9BYJ4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM34Q9BYJ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM34Q9BYJ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM34Q9BYJ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM34Q9BYJ4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM34Q9BYJ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM34Q9BYJ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM34Q9BYJ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms