Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CITED2Q99967 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED2Q99967 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms