Protein–RNA interactions for Protein: Q96EN9

C19orf60, Uncharacterized protein C19orf60, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf60Q96EN9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C19orf60Q96EN9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C19orf60Q96EN9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
C19orf60Q96EN9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms