Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDK2Q58EX2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDK2Q58EX2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDK2Q58EX2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms