RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338825.4

EIF4EBP1-201, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EIF4EBP1, Length 1,020 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1-201ENST00000338825 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.03■■■■■ 6.72
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.4■■■■■ 5.82
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ABCC9O60706 1549 aa51.21■■■■■ 5.79
EIF4EBP1-201ENST00000338825 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.83■■■■■ 5.41
EIF4EBP1-201ENST00000338825 NACADO15069 1562 aa48.5■■■■■ 5.35
EIF4EBP1-201ENST00000338825 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.09■■■■■ 5.29
EIF4EBP1-201ENST00000338825 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.94■■■■■ 5.26
EIF4EBP1-201ENST00000338825 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.86■■■■■ 5.25
EIF4EBP1-201ENST00000338825 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.8■■■■■ 5.24
EIF4EBP1-201ENST00000338825 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.53■■■■■ 5.2
EIF4EBP1-201ENST00000338825 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.48■■■■■ 5.19
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.28■■■■■ 5.16
EIF4EBP1-201ENST00000338825 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.2■■■■■ 5.15
EIF4EBP1-201ENST00000338825 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.86■■■■■ 5.09
EIF4EBP1-201ENST00000338825 SCRIBQ14160 1630 aa46.65■■■■■ 5.06
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.39■■■■■ 5.02
EIF4EBP1-201ENST00000338825 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.18■■■■■ 4.98
EIF4EBP1-201ENST00000338825 NCAPD3P42695 1498 aa44.72■■■■■ 4.75
EIF4EBP1-201ENST00000338825 SMARCA4P51532 1647 aa44.57■■■■■ 4.72
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.55■■■■■ 4.72
EIF4EBP1-201ENST00000338825 SMARCA2P51531 1590 aa44.47■■■■■ 4.71
EIF4EBP1-201ENST00000338825 HMGXB3Q12766 1538 aa44.46■■■■■ 4.71
EIF4EBP1-201ENST00000338825 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.29■■■■■ 4.68
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CUX2O14529 1486 aa44.28■■■■■ 4.68
EIF4EBP1-201ENST00000338825 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.25■■■■■ 4.67
EIF4EBP1-201ENST00000338825 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.2■■■■■ 4.67
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ERCC6Q03468 1493 aa44.2■■■■■ 4.67
EIF4EBP1-201ENST00000338825 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
EIF4EBP1-201ENST00000338825 NESP48681 1621 aa44■■■■■ 4.63
EIF4EBP1-201ENST00000338825 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.92■■■■■ 4.62
EIF4EBP1-201ENST00000338825 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.8■■■■■ 4.6
EIF4EBP1-201ENST00000338825 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
EIF4EBP1-201ENST00000338825 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.6■■■■■ 4.57
EIF4EBP1-201ENST00000338825 WIZO95785 1651 aa43.44■■■■■ 4.54
EIF4EBP1-201ENST00000338825 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.4■■■■■ 4.54
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.29■■■■■ 4.52
EIF4EBP1-201ENST00000338825 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.09■■■■■ 4.49
EIF4EBP1-201ENST00000338825 WDR62O43379 1518 aa43.08■■■■■ 4.49
EIF4EBP1-201ENST00000338825 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.89■■■■■ 4.46
EIF4EBP1-201ENST00000338825 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CFTRP13569 1480 aa42.84■■■■■ 4.45
EIF4EBP1-201ENST00000338825 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.81■■■■■ 4.44
EIF4EBP1-201ENST00000338825 PRDM2Q13029 1718 aa42.67■■■■■ 4.42
EIF4EBP1-201ENST00000338825 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.3■■■■■ 4.36
EIF4EBP1-201ENST00000338825 TRIM41Q8WV44 630 aa42.12■■■■■ 4.33
EIF4EBP1-201ENST00000338825 OSCARQ8IYS5 282 aa42.06■■■■■ 4.32
EIF4EBP1-201ENST00000338825 TOPBP1Q92547 1522 aa42.04■■■■■ 4.32
EIF4EBP1-201ENST00000338825 IFT140Q96RY7 1462 aa42.04■■■■■ 4.32
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ABCC8Q09428 1581 aa41.93■■■■■ 4.3
EIF4EBP1-201ENST00000338825 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.92■■■■■ 4.3
EIF4EBP1-201ENST00000338825 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
EIF4EBP1-201ENST00000338825 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
EIF4EBP1-201ENST00000338825 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.74■■■■■ 4.27
EIF4EBP1-201ENST00000338825 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.74■■■■■ 4.27
EIF4EBP1-201ENST00000338825 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.74■■■■■ 4.27
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CHD1O14646 1710 aa41.61■■■■■ 4.25
EIF4EBP1-201ENST00000338825 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ARHGEF11O15085 1522 aa41.55■■■■■ 4.24
EIF4EBP1-201ENST00000338825 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.52■■■■■ 4.24
EIF4EBP1-201ENST00000338825 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.38■■■■■ 4.21
EIF4EBP1-201ENST00000338825 WDR97A6NE52 1622 aa41.37■■■■■ 4.21
EIF4EBP1-201ENST00000338825 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.3■■■■■ 4.2
EIF4EBP1-201ENST00000338825 SOGA1O94964 1423 aa41.3■■■■■ 4.2
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CUX1P39880 1505 aa41.28■■■■■ 4.2
EIF4EBP1-201ENST00000338825 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
EIF4EBP1-201ENST00000338825 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.15■■■■■ 4.18
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ARAP1Q96P48 1450 aa41.13■■■■■ 4.17
EIF4EBP1-201ENST00000338825 FBLN2P98095 1184 aa41.09■■■■■ 4.17
EIF4EBP1-201ENST00000338825 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.08■■■■■ 4.17
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.04■■■■■ 4.16
EIF4EBP1-201ENST00000338825 PBRM1Q86U86 1689 aa41.03■■■■■ 4.16
EIF4EBP1-201ENST00000338825 GRIN2BQ13224 1484 aa41.02■■■■■ 4.16
EIF4EBP1-201ENST00000338825 SYNJ1O43426 1573 aa40.99■■■■■ 4.15
EIF4EBP1-201ENST00000338825 SYNJ2O15056 1496 aa40.93■■■■■ 4.14
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.9■■■■■ 4.14
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.87■■■■■ 4.13
EIF4EBP1-201ENST00000338825 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.86■■■■■ 4.13
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
EIF4EBP1-201ENST00000338825 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.71■■■■■ 4.11
EIF4EBP1-201ENST00000338825 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
EIF4EBP1-201ENST00000338825 TOP2BQ02880 1626 aa40.64■■■■■ 4.1
EIF4EBP1-201ENST00000338825 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.58■■■■■ 4.09
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ADAMTS12P58397 1594 aa40.57■■■■■ 4.09
EIF4EBP1-201ENST00000338825 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
EIF4EBP1-201ENST00000338825 GRIN2AQ12879 1464 aa40.52■■■■■ 4.08
EIF4EBP1-201ENST00000338825 CEP170Q5SW79 1584 aa40.44■■■■■ 4.06
EIF4EBP1-201ENST00000338825 NUP160Q12769 1436 aa40.42■■■■■ 4.06
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.37■■■■■ 4.05
EIF4EBP1-201ENST00000338825 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.37■■■■■ 4.05
EIF4EBP1-201ENST00000338825 SHROOM2Q13796 1616 aa40.37■■■■■ 4.05
EIF4EBP1-201ENST00000338825 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.33■■■■■ 4.05
EIF4EBP1-201ENST00000338825 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.02■■■■■ 4
EIF4EBP1-201ENST00000338825 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
EIF4EBP1-201ENST00000338825 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.91■■■■□ 3.98
EIF4EBP1-201ENST00000338825 JPH4Q96JJ6 628 aa39.83■■■■□ 3.97
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