Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SS18Q15532 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SS18Q15532 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SS18Q15532 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SS18Q15532 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SS18Q15532 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SS18Q15532 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SS18Q15532 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SS18Q15532 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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SS18Q15532 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SS18Q15532 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SS18Q15532 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SS18Q15532 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SS18Q15532 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SS18Q15532 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SS18Q15532 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SS18Q15532 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SS18Q15532 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SS18Q15532 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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SS18Q15532 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SS18Q15532 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SS18Q15532 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SS18Q15532 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SS18Q15532 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SS18Q15532 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SS18Q15532 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SS18Q15532 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SS18Q15532 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SS18Q15532 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18Q15532 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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SS18Q15532 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18Q15532 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18Q15532 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18Q15532 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18Q15532 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18Q15532 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18Q15532 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18Q15532 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18Q15532 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18Q15532 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18Q15532 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SS18Q15532 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SS18Q15532 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SS18Q15532 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SS18Q15532 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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