Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.881e-9■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.931e-9■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NQO1-205ENST00000561500 891 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.021e-9■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.061e-9■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.371e-9■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 HSD17B4-209ENST00000507695 324 ntTSL 55.05□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PSMD2-209ENST00000460628 565 ntTSL 211.53□□□□□ -0.566e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)26.15■■□□□ 1.784e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.624e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.374e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.854e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 216.56■□□□□ 0.244e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.494e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 AKR1C3-206ENST00000602997 636 ntTSL 35.98□□□□□ -1.458e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 AKR1C3-210ENST00000605322 846 ntTSL 1 (best)5.6□□□□□ -1.518e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.384e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.994e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.994e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.994e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 MACF1-207ENST00000442046 2299 ntTSL 516.69■□□□□ 0.264e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.847e-7■■■■□ 21.3
G3BP1Q13283 NSFL1C-204ENST00000461211 3799 ntTSL 58.44□□□□□ -1.066e-7■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 TNS3-204ENST00000428457 5070 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.492e-7■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 BAG6-262ENST00000470875 1000 ntTSL 526.98■■□□□ 1.914e-8■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.763e-7■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 COX5B-202ENST00000464949 613 ntTSL 525.18■■□□□ 1.623e-7■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 COX5B-203ENST00000491989 611 ntTSL 311.24□□□□□ -0.613e-7■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 UMPS-210ENST00000498715 832 ntTSL 312.13□□□□□ -0.474e-7■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.797e-13■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.797e-13■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.567e-13■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 PAICS-205ENST00000508554 698 ntTSL 210.18□□□□□ -0.785e-8■■■■□ 21.2
G3BP1Q13283 TCOF1-213ENST00000514442 5195 ntTSL 215.94■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AEN-204ENST00000558327 883 ntTSL 231.77■■■□□ 2.684e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 MSH2-203ENST00000454849 560 ntTSL 430.83■■■□□ 2.534e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AEN-205ENST00000559528 895 ntTSL 229.82■■■□□ 2.364e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AEN-206ENST00000560174 461 ntTSL 329.14■■■□□ 2.264e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.944e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.644e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-203ENST00000453708 617 ntTSL 224.76■■□□□ 1.554e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.554e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 PSMC3-203ENST00000526993 580 ntTSL 224.15■■□□□ 1.464e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.454e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-217ENST00000545112 788 ntTSL 224.13■■□□□ 1.454e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TMEM50A-206ENST00000498135 776 ntTSL 323.71■■□□□ 1.394e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.384e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-210ENST00000538277 565 ntTSL 423.69■■□□□ 1.384e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TMEM50A-203ENST00000480937 1102 ntTSL 223.2■■□□□ 1.34e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-212ENST00000541930 827 ntTSL 522.38■■□□□ 1.174e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-213ENST00000542347 988 ntTSL 221.65■■□□□ 1.064e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TMEM50A-202ENST00000468704 799 ntTSL 321.26■□□□□ 0.994e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.984e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.984e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATAD3A-201ENST00000339113 2330 ntTSL 221■□□□□ 0.954e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-211ENST00000540620 984 ntTSL 320.89■□□□□ 0.934e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AEN-202ENST00000557787 1242 ntTSL 1 (best)20.49■□□□□ 0.874e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.864e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.784e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.764e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-206ENST00000594067 2697 ntTSL 219.73■□□□□ 0.754e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AHSA1-213ENST00000557476 584 ntTSL 319.63■□□□□ 0.736e-8■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.724e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TSR1-202ENST00000571806 794 ntTSL 219.17■□□□□ 0.664e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.634e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.594e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.574e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TMEM50A-205ENST00000491936 965 ntTSL 1 (best)18.55■□□□□ 0.564e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.524e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.484e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.424e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.394e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 USP5-206ENST00000542087 438 ntTSL 317.5■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.334e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATP7B-207ENST00000466629 463 ntTSL 217.01■□□□□ 0.314e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.284e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATP7B-214ENST00000634810 5825 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATP7B-210ENST00000634296 2328 ntTSL 516.64■□□□□ 0.254e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TSR1-205ENST00000576202 573 ntTSL 216.05■□□□□ 0.164e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.094e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.024e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 04e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 FAH-211ENST00000561353 324 ntTSL 515.06■□□□□ 04e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TUBA1A-207ENST00000550767 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.044e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 AHSA1-210ENST00000556369 849 ntTSL 514.72□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-207ENST00000594759 4102 ntTSL 1 (best)14.09□□□□□ -0.154e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 HIF1AN-205ENST00000533589 1042 ntTSL 313.87□□□□□ -0.194e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-210ENST00000596332 584 ntTSL 213.11□□□□□ -0.314e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 ATP7B-213ENST00000634620 5653 ntTSL 1 (best)13.03□□□□□ -0.324e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 NUMB-202ENST00000356296 3453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.334e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-213ENST00000596672 792 ntTSL 312.96□□□□□ -0.334e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 GOLGA2-211ENST00000496221 450 ntTSL 312.7□□□□□ -0.384e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.384e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 FAH-209ENST00000559217 619 ntTSL 212.62□□□□□ -0.394e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 LIG1-220ENST00000601091 3957 ntTSL 512.43□□□□□ -0.424e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TCF20-201ENST00000335626 6237 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.434e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 WDR74-209ENST00000538150 487 ntTSL 312.2□□□□□ -0.464e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 21.1
G3BP1Q13283 TCP1-218ENST00000546204 566 ntTSL 210.85□□□□□ -0.674e-6■■■■□ 21.1
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