Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPN11Q06124 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPN11Q06124 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms