RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.03■■■■■ 6.72
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.83■■■■■ 5.73
CTDSP2-203ENST00000547701 ABCC9O60706 1549 aa49.6■■■■■ 5.53
CTDSP2-203ENST00000547701 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.83■■■■■ 5.25
CTDSP2-203ENST00000547701 NACADO15069 1562 aa47.83■■■■■ 5.25
CTDSP2-203ENST00000547701 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.66■■■■■ 5.22
CTDSP2-203ENST00000547701 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
CTDSP2-203ENST00000547701 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.36■■■■■ 5.17
CTDSP2-203ENST00000547701 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.35■■■■■ 5.17
CTDSP2-203ENST00000547701 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.73■■■■■ 5.07
CTDSP2-203ENST00000547701 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.4■■■■■ 5.02
CTDSP2-203ENST00000547701 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.27■■■■■ 5
CTDSP2-203ENST00000547701 SCRIBQ14160 1630 aa46.1■■■■■ 4.97
CTDSP2-203ENST00000547701 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.1■■■■■ 4.97
CTDSP2-203ENST00000547701 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.72■■■■■ 4.91
CTDSP2-203ENST00000547701 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.16■■■■■ 4.82
CTDSP2-203ENST00000547701 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.97■■■■■ 4.79
CTDSP2-203ENST00000547701 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.67■■■■■ 4.74
CTDSP2-203ENST00000547701 SMARCA4P51532 1647 aa44.24■■■■■ 4.67
CTDSP2-203ENST00000547701 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.22■■■■■ 4.67
CTDSP2-203ENST00000547701 NCAPD3P42695 1498 aa44.15■■■■■ 4.66
CTDSP2-203ENST00000547701 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.07■■■■■ 4.65
CTDSP2-203ENST00000547701 SMARCA2P51531 1590 aa44.03■■■■■ 4.64
CTDSP2-203ENST00000547701 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.97■■■■■ 4.63
CTDSP2-203ENST00000547701 HMGXB3Q12766 1538 aa43.89■■■■■ 4.62
CTDSP2-203ENST00000547701 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.87■■■■■ 4.61
CTDSP2-203ENST00000547701 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
CTDSP2-203ENST00000547701 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
CTDSP2-203ENST00000547701 WIZO95785 1651 aa43.35■■■■■ 4.53
CTDSP2-203ENST00000547701 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
CTDSP2-203ENST00000547701 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.96■■■■■ 4.47
CTDSP2-203ENST00000547701 NESP48681 1621 aa42.9■■■■■ 4.46
CTDSP2-203ENST00000547701 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.78■■■■■ 4.44
CTDSP2-203ENST00000547701 ERCC6Q03468 1493 aa42.76■■■■■ 4.44
CTDSP2-203ENST00000547701 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.64■■■■■ 4.42
CTDSP2-203ENST00000547701 CUX2O14529 1486 aa42.57■■■■■ 4.41
CTDSP2-203ENST00000547701 CFTRP13569 1480 aa42.54■■■■■ 4.4
CTDSP2-203ENST00000547701 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.44■■■■■ 4.38
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.43■■■■■ 4.38
CTDSP2-203ENST00000547701 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
CTDSP2-203ENST00000547701 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.22■■■■■ 4.35
CTDSP2-203ENST00000547701 PRDM2Q13029 1718 aa42.2■■■■■ 4.35
CTDSP2-203ENST00000547701 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.17■■■■■ 4.34
CTDSP2-203ENST00000547701 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.17■■■■■ 4.34
CTDSP2-203ENST00000547701 WDR62O43379 1518 aa42.09■■■■■ 4.33
CTDSP2-203ENST00000547701 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
CTDSP2-203ENST00000547701 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
CTDSP2-203ENST00000547701 ABCC8Q09428 1581 aa41.67■■■■■ 4.26
CTDSP2-203ENST00000547701 TOPBP1Q92547 1522 aa41.55■■■■■ 4.24
CTDSP2-203ENST00000547701 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.51■■■■■ 4.24
CTDSP2-203ENST00000547701 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.39■■■■■ 4.22
CTDSP2-203ENST00000547701 IFT140Q96RY7 1462 aa41.35■■■■■ 4.21
CTDSP2-203ENST00000547701 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
CTDSP2-203ENST00000547701 CUX1P39880 1505 aa41.17■■■■■ 4.18
CTDSP2-203ENST00000547701 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
CTDSP2-203ENST00000547701 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.02■■■■■ 4.16
CTDSP2-203ENST00000547701 SOGA1O94964 1423 aa41.01■■■■■ 4.15
CTDSP2-203ENST00000547701 WDR97A6NE52 1622 aa40.95■■■■■ 4.15
CTDSP2-203ENST00000547701 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
CTDSP2-203ENST00000547701 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.92■■■■■ 4.14
CTDSP2-203ENST00000547701 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.13
CTDSP2-203ENST00000547701 TOP2BQ02880 1626 aa40.84■■■■■ 4.13
CTDSP2-203ENST00000547701 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.84■■■■■ 4.13
CTDSP2-203ENST00000547701 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.83■■■■■ 4.137e-7■■■■□ 25.9
CTDSP2-203ENST00000547701 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.73■■■■■ 4.11
CTDSP2-203ENST00000547701 SYNJ1O43426 1573 aa40.72■■■■■ 4.11
CTDSP2-203ENST00000547701 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
CTDSP2-203ENST00000547701 OSCARQ8IYS5 282 aa40.7■■■■■ 4.11
CTDSP2-203ENST00000547701 GRIN2BQ13224 1484 aa40.57■■■■■ 4.08
CTDSP2-203ENST00000547701 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.55■■■■■ 4.08
CTDSP2-203ENST00000547701 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.53■■■■■ 4.08
CTDSP2-203ENST00000547701 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
CTDSP2-203ENST00000547701 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.45■■■■■ 4.07
CTDSP2-203ENST00000547701 CHD1O14646 1710 aa40.43■■■■■ 4.06
CTDSP2-203ENST00000547701 PBRM1Q86U86 1689 aa40.43■■■■■ 4.06
CTDSP2-203ENST00000547701 SYNJ2O15056 1496 aa40.33■■■■■ 4.05
CTDSP2-203ENST00000547701 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.26■■■■■ 4.03
CTDSP2-203ENST00000547701 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
CTDSP2-203ENST00000547701 FBLN2P98095 1184 aa40.22■■■■■ 4.03
CTDSP2-203ENST00000547701 ADAMTS12P58397 1594 aa40.13■■■■■ 4.01
CTDSP2-203ENST00000547701 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.1■■■■■ 4.01
CTDSP2-203ENST00000547701 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.09■■■■■ 4.01
CTDSP2-203ENST00000547701 KIF27Q86VH2 1401 aa40.04■■■■■ 4
CTDSP2-203ENST00000547701 GRIN2AQ12879 1464 aa40.04■■■■■ 4
CTDSP2-203ENST00000547701 ARHGEF11O15085 1522 aa40.02■■■■■ 4
CTDSP2-203ENST00000547701 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.02■■■■■ 4
CTDSP2-203ENST00000547701 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.02■■■■■ 4
CTDSP2-203ENST00000547701 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.02■■■■■ 4
CTDSP2-203ENST00000547701 NUP160Q12769 1436 aa39.93■■■■□ 3.98
CTDSP2-203ENST00000547701 IGF1RP08069 1367 aa39.93■■■■□ 3.98
CTDSP2-203ENST00000547701 CUL7Q14999 1698 aa39.83■■■■□ 3.97
CTDSP2-203ENST00000547701 CEP170Q5SW79 1584 aa39.8■■■■□ 3.96
CTDSP2-203ENST00000547701 TRIM41Q8WV44 630 aa39.7■■■■□ 3.95
CTDSP2-203ENST00000547701 ARAP1Q96P48 1450 aa39.68■■■■□ 3.94
CTDSP2-203ENST00000547701 SHROOM2Q13796 1616 aa39.66■■■■□ 3.94
CTDSP2-203ENST00000547701 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.64■■■■□ 3.94
CTDSP2-203ENST00000547701 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.56■■■■□ 3.92
CTDSP2-203ENST00000547701 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.54■■■■□ 3.92
CTDSP2-203ENST00000547701 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.5■■■■□ 3.91
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