Protein–RNA interactions for Protein: P62269

RPS18, 40S ribosomal protein S18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS18P62269 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS18P62269 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS18P62269 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS18P62269 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS18P62269 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS18P62269 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS18P62269 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS18P62269 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS18P62269 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS18P62269 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS18P62269 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS18P62269 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS18P62269 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS18P62269 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS18P62269 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS18P62269 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS18P62269 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS18P62269 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS18P62269 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS18P62269 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS18P62269 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS18P62269 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS18P62269 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS18P62269 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS18P62269 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS18P62269 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS18P62269 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS18P62269 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS18P62269 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS18P62269 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS18P62269 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS18P62269 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS18P62269 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS18P62269 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS18P62269 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS18P62269 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS18P62269 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS18P62269 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS18P62269 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS18P62269 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS18P62269 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS18P62269 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS18P62269 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS18P62269 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS18P62269 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS18P62269 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS18P62269 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS18P62269 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS18P62269 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS18P62269 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS18P62269 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS18P62269 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS18P62269 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS18P62269 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS18P62269 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS18P62269 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS18P62269 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS18P62269 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS18P62269 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS18P62269 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS18P62269 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS18P62269 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS18P62269 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS18P62269 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS18P62269 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS18P62269 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS18P62269 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS18P62269 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS18P62269 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS18P62269 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS18P62269 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS18P62269 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS18P62269 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS18P62269 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS18P62269 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS18P62269 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS18P62269 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS18P62269 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS18P62269 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS18P62269 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS18P62269 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS18P62269 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS18P62269 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS18P62269 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS18P62269 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS18P62269 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms