Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXA6P31267 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA6P31267 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms