Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABRR1P24046 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GABRR1P24046 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms