Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GABRR1P24046 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABRR1P24046 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABRR1P24046 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GABRR1P24046 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GABRR1P24046 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GABRR1P24046 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GABRR1P24046 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GABRR1P24046 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GABRR1P24046 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABRR1P24046 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GABRR1P24046 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GABRR1P24046 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABRR1P24046 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABRR1P24046 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABRR1P24046 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABRR1P24046 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRR1P24046 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRR1P24046 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRR1P24046 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRR1P24046 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRR1P24046 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GABRR1P24046 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GABRR1P24046 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GABRR1P24046 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GABRR1P24046 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GABRR1P24046 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GABRR1P24046 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GABRR1P24046 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRR1P24046 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRR1P24046 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRR1P24046 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRR1P24046 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRR1P24046 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRR1P24046 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRR1P24046 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABRR1P24046 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRR1P24046 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRR1P24046 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRR1P24046 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRR1P24046 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRR1P24046 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRR1P24046 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABRR1P24046 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRR1P24046 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRR1P24046 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRR1P24046 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRR1P24046 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRR1P24046 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRR1P24046 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRR1P24046 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRR1P24046 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR1P24046 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRR1P24046 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRR1P24046 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABRR1P24046 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABRR1P24046 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABRR1P24046 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GABRR1P24046 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GABRR1P24046 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRR1P24046 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GABRR1P24046 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRR1P24046 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRR1P24046 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRR1P24046 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRR1P24046 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABRR1P24046 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRR1P24046 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRR1P24046 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRR1P24046 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRR1P24046 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRR1P24046 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRR1P24046 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRR1P24046 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABRR1P24046 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRR1P24046 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRR1P24046 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRR1P24046 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRR1P24046 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRR1P24046 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRR1P24046 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRR1P24046 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABRR1P24046 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRR1P24046 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRR1P24046 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRR1P24046 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR1P24046 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR1P24046 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR1P24046 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR1P24046 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRR1P24046 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR1P24046 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR1P24046 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRR1P24046 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR1P24046 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR1P24046 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRR1P24046 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR1P24046 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABRR1P24046 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABRR1P24046 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms