Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STMN1P16949 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STMN1P16949 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STMN1P16949 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STMN1P16949 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STMN1P16949 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STMN1P16949 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STMN1P16949 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STMN1P16949 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STMN1P16949 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
STMN1P16949 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
STMN1P16949 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STMN1P16949 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STMN1P16949 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
STMN1P16949 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
STMN1P16949 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STMN1P16949 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
STMN1P16949 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STMN1P16949 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STMN1P16949 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STMN1P16949 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STMN1P16949 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STMN1P16949 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
STMN1P16949 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STMN1P16949 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STMN1P16949 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STMN1P16949 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STMN1P16949 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
STMN1P16949 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STMN1P16949 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STMN1P16949 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STMN1P16949 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STMN1P16949 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STMN1P16949 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STMN1P16949 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STMN1P16949 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STMN1P16949 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STMN1P16949 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STMN1P16949 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STMN1P16949 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STMN1P16949 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STMN1P16949 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STMN1P16949 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
STMN1P16949 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STMN1P16949 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STMN1P16949 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STMN1P16949 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STMN1P16949 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STMN1P16949 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STMN1P16949 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STMN1P16949 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STMN1P16949 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STMN1P16949 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STMN1P16949 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STMN1P16949 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STMN1P16949 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STMN1P16949 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STMN1P16949 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STMN1P16949 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STMN1P16949 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STMN1P16949 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STMN1P16949 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STMN1P16949 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STMN1P16949 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STMN1P16949 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STMN1P16949 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STMN1P16949 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STMN1P16949 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STMN1P16949 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STMN1P16949 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STMN1P16949 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STMN1P16949 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STMN1P16949 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STMN1P16949 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STMN1P16949 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STMN1P16949 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STMN1P16949 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STMN1P16949 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STMN1P16949 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STMN1P16949 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STMN1P16949 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STMN1P16949 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STMN1P16949 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
STMN1P16949 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STMN1P16949 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STMN1P16949 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STMN1P16949 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STMN1P16949 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STMN1P16949 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STMN1P16949 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STMN1P16949 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STMN1P16949 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STMN1P16949 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STMN1P16949 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STMN1P16949 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STMN1P16949 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STMN1P16949 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STMN1P16949 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STMN1P16949 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STMN1P16949 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms