Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF44P15621 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZNF44P15621 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF44P15621 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms