Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGAVP06756 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGAVP06756 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAVP06756 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms