Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOO75962 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOO75962 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOO75962 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOO75962 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIOO75962 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOO75962 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOO75962 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOO75962 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOO75962 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOO75962 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOO75962 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOO75962 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOO75962 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIOO75962 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIOO75962 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIOO75962 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIOO75962 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIOO75962 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIOO75962 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIOO75962 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIOO75962 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIOO75962 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIOO75962 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIOO75962 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIOO75962 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIOO75962 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIOO75962 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIOO75962 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIOO75962 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIOO75962 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIOO75962 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIOO75962 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIOO75962 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIOO75962 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIOO75962 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIOO75962 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIOO75962 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIOO75962 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIOO75962 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIOO75962 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIOO75962 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIOO75962 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIOO75962 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIOO75962 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIOO75962 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIOO75962 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIOO75962 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIOO75962 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIOO75962 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIOO75962 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIOO75962 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIOO75962 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIOO75962 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIOO75962 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIOO75962 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIOO75962 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIOO75962 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIOO75962 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIOO75962 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIOO75962 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIOO75962 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIOO75962 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIOO75962 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIOO75962 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIOO75962 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIOO75962 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIOO75962 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIOO75962 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIOO75962 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIOO75962 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIOO75962 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIOO75962 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIOO75962 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIOO75962 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIOO75962 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIOO75962 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIOO75962 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIOO75962 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIOO75962 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIOO75962 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIOO75962 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIOO75962 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIOO75962 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIOO75962 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIOO75962 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIOO75962 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIOO75962 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIOO75962 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIOO75962 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIOO75962 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIOO75962 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIOO75962 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIOO75962 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIOO75962 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIOO75962 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIOO75962 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIOO75962 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIOO75962 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIOO75962 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms