Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCTPQ9UKL6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCTPQ9UKL6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCTPQ9UKL6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCTPQ9UKL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms