Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KB2Q9UBS0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS6KB2Q9UBS0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS6KB2Q9UBS0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms