Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRCC1Q9NPI7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRCC1Q9NPI7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRCC1Q9NPI7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms