Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
AGPAT1Q99943 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
AGPAT1Q99943 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AGPAT1Q99943 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AGPAT1Q99943 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms