Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAMD8Q96LT4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD8Q96LT4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD8Q96LT4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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