Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRRC59Q96AG4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LRRC59Q96AG4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LRRC59Q96AG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
LRRC59Q96AG4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
LRRC59Q96AG4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC59Q96AG4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC59Q96AG4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC59Q96AG4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC59Q96AG4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC59Q96AG4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
LRRC59Q96AG4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
LRRC59Q96AG4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms