Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYDE1Q6ZW31 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYDE1Q6ZW31 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYDE1Q6ZW31 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYDE1Q6ZW31 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms