Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIF1AQ16665 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIF1AQ16665 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIF1AQ16665 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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