Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HIF1AQ16665 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HIF1AQ16665 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HIF1AQ16665 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
HIF1AQ16665 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
HIF1AQ16665 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HIF1AQ16665 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HIF1AQ16665 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HIF1AQ16665 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
HIF1AQ16665 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HIF1AQ16665 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HIF1AQ16665 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HIF1AQ16665 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HIF1AQ16665 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HIF1AQ16665 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HIF1AQ16665 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HIF1AQ16665 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HIF1AQ16665 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HIF1AQ16665 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HIF1AQ16665 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HIF1AQ16665 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HIF1AQ16665 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HIF1AQ16665 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
HIF1AQ16665 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
HIF1AQ16665 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HIF1AQ16665 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HIF1AQ16665 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HIF1AQ16665 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HIF1AQ16665 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HIF1AQ16665 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIF1AQ16665 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HIF1AQ16665 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HIF1AQ16665 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HIF1AQ16665 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
HIF1AQ16665 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HIF1AQ16665 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HIF1AQ16665 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HIF1AQ16665 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HIF1AQ16665 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HIF1AQ16665 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HIF1AQ16665 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIF1AQ16665 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HIF1AQ16665 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HIF1AQ16665 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIF1AQ16665 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HIF1AQ16665 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
HIF1AQ16665 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HIF1AQ16665 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HIF1AQ16665 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
HIF1AQ16665 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HIF1AQ16665 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIF1AQ16665 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HIF1AQ16665 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HIF1AQ16665 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HIF1AQ16665 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HIF1AQ16665 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HIF1AQ16665 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HIF1AQ16665 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HIF1AQ16665 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HIF1AQ16665 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HIF1AQ16665 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HIF1AQ16665 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HIF1AQ16665 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HIF1AQ16665 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIF1AQ16665 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIF1AQ16665 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HIF1AQ16665 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HIF1AQ16665 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HIF1AQ16665 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HIF1AQ16665 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HIF1AQ16665 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HIF1AQ16665 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HIF1AQ16665 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HIF1AQ16665 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HIF1AQ16665 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HIF1AQ16665 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HIF1AQ16665 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HIF1AQ16665 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HIF1AQ16665 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HIF1AQ16665 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIF1AQ16665 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HIF1AQ16665 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HIF1AQ16665 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
HIF1AQ16665 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIF1AQ16665 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIF1AQ16665 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HIF1AQ16665 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HIF1AQ16665 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HIF1AQ16665 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIF1AQ16665 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HIF1AQ16665 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HIF1AQ16665 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HIF1AQ16665 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HIF1AQ16665 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HIF1AQ16665 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIF1AQ16665 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIF1AQ16665 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIF1AQ16665 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIF1AQ16665 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HIF1AQ16665 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
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