Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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PDE6HQ13956 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PDE6HQ13956 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PDE6HQ13956 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE6HQ13956 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PDE6HQ13956 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PDE6HQ13956 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PDE6HQ13956 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PDE6HQ13956 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PDE6HQ13956 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PDE6HQ13956 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE6HQ13956 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PDE6HQ13956 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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PDE6HQ13956 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE6HQ13956 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE6HQ13956 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDE6HQ13956 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDE6HQ13956 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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