Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD47Q08722 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD47Q08722 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD47Q08722 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD47Q08722 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD47Q08722 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD47Q08722 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD47Q08722 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD47Q08722 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD47Q08722 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD47Q08722 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD47Q08722 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD47Q08722 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD47Q08722 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD47Q08722 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD47Q08722 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD47Q08722 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD47Q08722 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD47Q08722 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD47Q08722 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD47Q08722 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD47Q08722 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD47Q08722 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD47Q08722 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD47Q08722 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD47Q08722 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD47Q08722 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD47Q08722 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD47Q08722 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD47Q08722 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD47Q08722 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD47Q08722 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD47Q08722 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD47Q08722 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD47Q08722 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD47Q08722 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD47Q08722 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD47Q08722 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD47Q08722 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD47Q08722 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD47Q08722 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD47Q08722 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD47Q08722 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD47Q08722 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD47Q08722 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD47Q08722 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD47Q08722 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD47Q08722 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD47Q08722 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD47Q08722 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD47Q08722 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD47Q08722 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD47Q08722 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD47Q08722 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD47Q08722 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD47Q08722 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD47Q08722 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD47Q08722 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD47Q08722 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD47Q08722 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD47Q08722 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD47Q08722 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD47Q08722 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD47Q08722 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD47Q08722 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD47Q08722 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD47Q08722 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD47Q08722 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD47Q08722 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD47Q08722 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD47Q08722 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD47Q08722 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD47Q08722 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD47Q08722 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD47Q08722 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD47Q08722 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD47Q08722 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD47Q08722 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD47Q08722 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD47Q08722 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD47Q08722 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD47Q08722 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD47Q08722 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD47Q08722 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD47Q08722 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD47Q08722 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD47Q08722 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD47Q08722 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD47Q08722 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD47Q08722 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD47Q08722 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD47Q08722 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD47Q08722 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD47Q08722 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD47Q08722 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD47Q08722 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD47Q08722 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD47Q08722 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD47Q08722 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD47Q08722 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 414.3 ms