Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RELBQ01201 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RELBQ01201 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RELBQ01201 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RELBQ01201 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RELBQ01201 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RELBQ01201 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RELBQ01201 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RELBQ01201 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RELBQ01201 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RELBQ01201 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RELBQ01201 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RELBQ01201 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RELBQ01201 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RELBQ01201 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RELBQ01201 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RELBQ01201 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RELBQ01201 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RELBQ01201 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RELBQ01201 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RELBQ01201 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RELBQ01201 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RELBQ01201 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RELBQ01201 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RELBQ01201 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RELBQ01201 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RELBQ01201 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RELBQ01201 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RELBQ01201 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RELBQ01201 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RELBQ01201 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RELBQ01201 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RELBQ01201 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RELBQ01201 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RELBQ01201 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RELBQ01201 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RELBQ01201 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RELBQ01201 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RELBQ01201 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RELBQ01201 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RELBQ01201 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RELBQ01201 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RELBQ01201 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RELBQ01201 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RELBQ01201 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RELBQ01201 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RELBQ01201 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RELBQ01201 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RELBQ01201 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RELBQ01201 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RELBQ01201 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RELBQ01201 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RELBQ01201 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RELBQ01201 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RELBQ01201 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RELBQ01201 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RELBQ01201 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELBQ01201 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELBQ01201 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELBQ01201 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELBQ01201 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RELBQ01201 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELBQ01201 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELBQ01201 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELBQ01201 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELBQ01201 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RELBQ01201 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RELBQ01201 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RELBQ01201 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RELBQ01201 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RELBQ01201 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RELBQ01201 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms