Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGGT1BP53609 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGT1BP53609 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGGT1BP53609 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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