Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTHFD2P13995 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MTHFD2P13995 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTHFD2P13995 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms