Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPREB1P12018 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB1P12018 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms