Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LINC00032P0C843 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC00032P0C843 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms